Correcto estimado @jagm8924, este procedimiento es válido cuando tienes obras lineales que relativamente sean paralelos, no es necesario que lo sean totalmente, depende del factor de tolerancia con la cual quieres generar los datos. Si tomamos en cuenta que en cada una de las líneas de muestreo calculará el volumen por el método de áreas medias, entonces podríamos estar satisfechos en que finalmente el volumen seguirá siendo representativo por la aplicación de este método. Pero si tenemos por ejemplo mucha variación y tenemos algunas curvas que totalmente no se parecen a la primera obra lineal entonces vamos a tener resultados disparados. En la imagen que muestras si consideramos que la alineación superior es la que definirá las líneas de muestreo (extendiendose para cubrir la de abajo), entonces las secciones muestreadas de la segunda serán las que te indico en color rojo. Al tomar secciones más largas en la segunda obra lineal entonces tendrás volúmenes mayores:

Pero entiendo que en tema de volúmenes lo que buscamos es presentar los mismos de la forma más precisa posible, entonces, si este factor de tolerancia estuviese fuera de tus expectativas, tendríamos que considerar lo siguiente:
No es posible de manera DIRECTA presentar dos obras lineales en UNA MISMA sección transversal y que estos se presenten de forma transversal y perpendicular a sus ejes respectivos. Solamente podremos lograrlo con el primero. Así que los volúmenes que tendrás siempre que presentes dos obras lineales en una misma sección serán donde se realice el corte (línea de muestreo).
Ahora, que lo anterior no sea posible de manera automática o directa no significa que no pueda realizarse. Te presento a continuación dos maneras que se me ocurren y es como yo solucionaría este problema. Te anticipo que son soluciones que requieren más operaciones o "artificios" para lograr nuestro objetivo, así como más tiempo. Pero en último caso nos dan los resultados que deseas.
PRIMERA SOLUCIÓN: "UNA MISMA LÍNEA DE MUESTREO ORTOGONAL A CADA UNO DE LOS EJES"
La primera tiene que ver con preparar las líneas de muestreo, es decir, podemos rotarlas, girarlas y aún utilizar polilineas creadas para definir nuestras líneas de muestreo, de tal manera de que estas se encuentren perpendiculares a cada uno de los ejes deseados.
Para el ejemplo tengo dos obras lineales y como ves las líneas de muestreo sólo son perpendiculares al eje en la de abajo, ya que en base a esa alineación se crearon, y podemos ver que la de arriba tiene el problema similar al tuyo.

Para esto, podemos realizar la siguiente operación a fin de no tener líneas de muestreo "de orientación continua" sino rotadas. Yo lo haré rápidamente, pero tú podrías hacerlo con precisión:

El concepto que tenemos que considerar aquí es que la línea de muestreo representará la sección que definimos geométricamente en planta. Lo único que hemos realizado es acomodar la línea para que se ajuste lo mayor posible a su progresiva transversal y perpendicular correspondiente. Pero notarás que tenemos un problema. Al haber "intentado" arreglar la de arriba" hemos descuidado la de abajo, ya que no estamos garantizando que sea perpendicular al eje la parte que cubre. Entonces, lo que tendríamos que hacer es no utilizar la alineación inferior, ya que el punto de rotación o pivote se encuentra en el eje. Tenemos que definir un nuevo eje que podría estar al centro de las dos alineaciones y crear esta alineación sería sencillo. A continuación te muestro lo que tendríamos que tener como resultado:

El problema que encontramos de la anterior manera es que no fácilmente lograremos con las modificaciones que la línea de muestreo sea ortogonal a cada una de las dos alineaciones "EN LA PROGRESIVA DESEADA". Tal vez en algunas sea más fácil y en otras tengamos algo aproximado. Por lo tanto aunque es una opción no resuelve con suma precisión lo que requerimos.
Para eso tenemos otra forma de crear las líneas de muestreo. Este procedimiento, como se dijo anteriormente, requiere mucho tiempo, entonces tenemos que decidir entre "precisión" y "tiempo", sobre todo si tenemos una obra lineal realmente extensa. Lo que podemos hacer es crear nuestras líneas de muestreo a partir de polilineas y si logramos tener las polilineas que corten ortogonalmente a las alineaciones y también exactamente en la progresiva deseada, entonces vamos a tener la tabla con datos sumamente precisos, así como lo quieres.
Creamos las líneas polilineas en la progresiva que corresponde a cada una de ellas y luego las unimos para tener una línea de muestreo que corte ortogonalmente a cada una y también en la progresiva exacta:

Ahora solamente faltaría convertir esas polilineas a líneas de muestreo:

Entonces tendremos la comparación de áreas ortogonales a los ejes y en las progresivas correspondiente y tendríamos la solución. Ahora si tenemos datos correctos:

SEGUNDA SOLUCIÓN: RECURRIR A DOS VISTAS DE SECCIONES TRANSVERSALES
Si queremos evitar lo anterior, que de alguna manera requiere más operaciones, algo no tan convencional, pero que solucionaría de alguna manera el problema es que podrías crear dos vistas de secciones transversales (en el mismo punto de inserción), cada una de ellas con su tabla correspondiente. La primera tendrá las dos obras lineales en su presentación, la segunda no se visualizará, tendrá todos los elementos apagados, solo utilizaremos su tabla para acomodarla en el lugar que corresponda en la primera vista. De tal manera que veremos la sección transversal y tabla de materiales 1, acompañada únicamente de la tabla de sección 2. Ojo, que este proceso requerirá el uso de mismo parámetros de sección transversal para que la ubicación de rejilla que determina la posición de secciones sea la misma en ambos.

Me gusta más la primera. Me parece que aunque exige mayor cantidad de operaciones, es más adecuado considerando que la segunda requiere conocimientos sobre manejo de rejilla vertical y horizontal para el trazado de secciones transversales y esto en cierto aspecto es algo complejo. Espero esto pueda ayudarte mi estimado. Un saludo.
Van Miguel M.