Como poder, si que puedes. Pero la afectación al ser una tubería de una sola pieza, va a afectar a toda esa tubería.
Por eso te comentaba lo de hacer las tuberías por tramos. Pero a lo que vamos respecto a tu pregunta:
"No se podría generar un tipo de linea en "Estilos de línea" que fuera líneas ocultas de tubería?, intente hacerlo pero no se como aplicárselo después, al igual que existe <MAs alla>, <Lineas ocultas>, etc?".
Así es como yo lo haría.
1º Ve a gestionar, configuración adicional, patrones de línea. Creas una nueva como tu la quieras hacer (te paso pantallazo con un ejemplo)

2º Acto seguido, cuando la hayas creado, te diriges de nuevo a gestionar pero esta vez a estilos de línea. Creas una nueva y el patrón que eliges es el que habías creado justo antes.

3ºDe nuevo en gestionar, estilo de objetos, te diriges a tuberías y allí modificas el patrón de línea por el que tú creaste.

Y te quedaría así:

El problema que vas a seguir teniendo es que la tubería no discrimina si va por muro, por suelo, por tabique o encima de un falso techo.
Espero haberte aclarado algo