こんにちは。
削除:削除しようとしているコンポーネント(またはボディ)に関連するすべての履歴情報を削除します。そのため、場合によっては関連する履歴情報がエラーになる場合があります。
除去:履歴情報に「除去した」という情報を新たに加えることでコンポーネント(またはボディ)を削除します。そのため、<削除>を使った場合のようなエラーは発生しません。
使い分けとしては、<削除>は完全にその形状に関するものをすべて消してしまいたいときに使用します。
<除去>は、例えば[ボディを分割]コマンド等で2形状に分かれた形状に対して、片側が不要なときに使用します。この時、<削除>を行うと、分割する前のボディ自体を履歴から削除することになりますので、2形状とも消えてしまいます。