Saludos.

Debes hacer lo siguiente:

1- Seleccionar el Project Base Point y desenlazarlo del Survey Point (liberar el clip)

2-Asignar esa elevación al Survey Point y al Project Base Point (dices que vas a usar la misma cota para ambos elementos), luego debes indicar a los tipos de nivel de cual punto toman la referencia, lo mismo deberás hacer con todos los marcadores de elevación.

Espero te sea útil. Éxito