En las siguientes imágenes se puede apreciar lo que sucede.

IMG 1: Configuración de exportación en Revit para muros exteriores e interiores (coloqué algunos muros como interiores para ver el resultado en Autocad)

IMG 2: El resultado de la exportación. Exploté el bloque generado y se puede apreciar que las líneas están en capas diferenciadas, pero con la propiedad color por elemento y no por capa.

IMG 3: Después de modificar la propiedad de color de las líneas por capa.