Hola

Las habitaciones se delimitan por los elementos constructivos, debes revisar si tienes huecos, por ejemplo, que los pilares no lleguen al nivel y sin desfase.

y que el suelo donde pisas sea el del nivel, 

por ejemplo, en la imagen el nivel 1 a 3.20m y el suelo acabado está a 3.20m, pero el suelo estructural está a 3.10m

o modifica la altura de cálculo de los niveles, 

saludos