Hola @juanfelipecordoba89 

No se si ya resolviste la duda que tenias. Si aun no la has resulto aquí va una respuesta un poco más explicita porque, yo también tengo los modelos estructurales como links en los modelos arquitectónicos. 

Debes ajustar el rango de vista primero, y luego en Visibilidad Grafica personalizar la opción Vínculos de Revit.

Rango de vista superior en -0.20m al menos, o a la altura que se encuentren las vigas, y en visibilidad grafica activas la opción personalizada y le puedes poner líneas puntadas, como se ve en las imágenes adjuntas. 

Saludos,