Hola estimado @jose_laynez, un gusto saludarte.
Si lo que deseas es diseñar/dimensionar cunetas, puedes utilizar la herramienta Hydraflow Espress que viene integrada en C3D, esta la puedes encontrar en la cinta de opciones-->pestaña Analyze-->panel Design.

Por otro lado, lo que comentas de SSA no es del todo cierto ya que en SSA puedes simular el flujo en cunetas y no solo asignar los caudales a los pozos, si tienes una red compuesta de tragantes/imbornales/inlets, etc. estas estructuras de captacion seran las que reciban primero el flujo y luego los descargues en tu red principal (pozos) y para simular las cunetas puedes hacer uso de la opcion Roadway/gutter bypass link y Upstream roadway link, de esta manera el caudal que no pueda ser captado por un inlet que no tenga la suficiente capacidad/eficiencia sera trasnmitido al siguiente inlet y asi sucesivamente.

Ademas puedes personalizar la forma del elemento bypass link de tal manera que simule tu cuneta.

Tambien debes tener claro que SSA solo realiza analisis 1D, si requieres un analisis 2D puedes utilizar Infodrainage o InfoWorks que son tambien productos de Autodesk y tienen muchas otras caracteristicas interesantes que SSA no posee.
saludos